Eksperti konstatējuši, ka aptuveni 10% no mazā ērgļa ligzdām katru gadu cieš no mežizstrādes ietekmes. Latvijas Dabas fonds  un Latvijas Ornitoloģijas biedrība ir atklājuši, ka Latvijā katru gadu apmēram 10% no jaunatklātajām un vēl neaizsargātajām mazo ērgļu ligzdām ietekmē saimnieciskā darbība, daudzos gadījumos faktiski iznīcinot to dzīvotnes. Tāpēc organizācijas aicina atbildīgās valsts iestādes izvērtēt konkrētos gadījumus un veikt esošā normatīvā regulējuma uzlabošanu, lai nepieļautu šādu gadījumu atkārtošanos nākotnē.